無需編程、隨想隨做
五款RNA研究APP
五款DNA研究APP
標(biāo)準(zhǔn)化分析：可視化操作，參數(shù)自定義，無需編程即可做生信分析
個(gè)性化分析：深入解讀，無需等待溝通結(jié)果，隨想隨做
100+分析工具
覆蓋面全：數(shù)據(jù)處理、基因功能注釋、繪圖等功能一應(yīng)俱全
靈活組合：小工具之間或與APP可靈活組合，適應(yīng)特有分析流程
公共數(shù)據(jù)挖掘
探索數(shù)據(jù)背后的生物學(xué)價(jià)值
公共測序數(shù)據(jù)庫：一鍵下載、整合分析
82000
G測序數(shù)據(jù)
25583
個(gè)樣本數(shù)據(jù)
27099
篇研究相關(guān)文獻(xiàn)
1028
篇影響因子10分以上文獻(xiàn)
32639條水稻基因功能信息
功能信息涵蓋
基因.png)
公共數(shù)據(jù)分析思路
分析思路1
共表達(dá)分析中，整合大量相關(guān)公共樣本測序數(shù)據(jù)，可構(gòu)建出相較于常規(guī)樣本量下可靠度更高的基因共表達(dá)網(wǎng)絡(luò)，從而基于該網(wǎng)絡(luò)進(jìn)行更加準(zhǔn)確的后續(xù)分析：a）預(yù)測目標(biāo)轉(zhuǎn)錄因子的下游調(diào)控基因、目標(biāo)調(diào)控網(wǎng)絡(luò)中的關(guān)鍵轉(zhuǎn)錄因子；b）預(yù)測ncRNA與mRNA之間的靶向關(guān)系；c）基于網(wǎng)絡(luò)中已知功能基因推測同網(wǎng)絡(luò)中其他功能未知基因功能；d) 將每個(gè)共表達(dá)模塊分別作為一個(gè)整體，計(jì)算其與各組織或各發(fā)育時(shí)間點(diǎn)之間的相關(guān)性，建立各組織相關(guān)或各時(shí)期相關(guān)基因表達(dá)網(wǎng)絡(luò)……
支撐文獻(xiàn)：
[1] Wisecaver JH et al. A Global Coexpression Network Approach for Connecting Genes to Specialized Metabolic Pathways in Plants. Plant Cell. 2017
[2] Yu C et al. Transcriptome dynamics of developing maize leaves and genomewide prediction of cis elements and their cognate transcription factors. Proc Natl Acad Sci . 2015
分析思路2
研究某一類基因的轉(zhuǎn)錄水平在不同處理下（或不同組織部位間、或不同發(fā)育時(shí)間點(diǎn)等）的變化規(guī)律，可整合多個(gè)類似研究中的公共測序數(shù)據(jù)來共同揭示該變化規(guī)律，使結(jié)果更加可靠。
支撐文獻(xiàn)：
[1] Patil G. et al. Soybean (Glycine max) SWEET gene family: insights through comparative genomics, transcriptome profiling and whole genome re-sequence analysis. BMC Genomics. 2015
[2] Matthijs M et al.Profiling of the Early Nitrogen Stress Response in the Diatom Phaeodactylum tricornutum Reveals a Novel Family of RING-Domain Transcription Factors. Plant Physiol. 2016
其他分析思路
1. 整合同一物種公共測序數(shù)據(jù)，構(gòu)建物種完備轉(zhuǎn)錄本序列參考集，用于后續(xù)功能分析。
支撐文獻(xiàn)：
Iyer MK et al. The landscape of long noncoding RNAs in the human transcriptome. Nat Genet. 2015
2. mRNA-ncRNA聯(lián)合分析中，利用公共數(shù)據(jù)補(bǔ)充其中一種類型的RNA測序數(shù)據(jù)。
支撐文獻(xiàn)：
Liu X et al. MicroRNA-mRNA regulatory networking fine-tunes the porcine muscle fiber type, muscular mitochondrial respiratory and metabolic enzyme activities. BMC Genomics. 2016
生信科研學(xué)習(xí)平臺
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（7款基礎(chǔ)、20款生信、
15款轉(zhuǎn)錄調(diào)控工具） - 分析平臺和工具支持的水稻公共測序數(shù)據(jù)
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- 104款分析工具
（7款基礎(chǔ)、20款生信、15款轉(zhuǎn)錄調(diào)控、29款基因組、12款繪圖、15款群體、6款非編碼RNA工具） - 分析平臺和工具支持的水稻公共測序數(shù)據(jù)
82000G
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32639條
條水稻基因功能信息
- 8核CPU，32GB內(nèi)存，4個(gè)節(jié)點(diǎn)16核CPU，96GB內(nèi)存，1個(gè)節(jié)點(diǎn)
3000G獨(dú)享存儲，500G共享存儲 - 線上100+教學(xué)培訓(xùn)